Мала інтерферуюча РНК (siRNA), також відома як коротка інтерферуюча РНК або глушна РНК, є класом дволанцюгових молекул РНК (20–25 п.о довжина) і перешкоджає експресії специфічних генів із комплементарними нуклеотидними послідовностями.
Замовчування гена в результаті siRNA можна оцінити вже через 24 години після трансфекції. Ефект найчастіше триватиме від 5–7 днів. Однак тривалість і рівень нокдауну залежать від типу клітини та концентрації siRNA. Трансфекції можна повторювати, щоб підтримувати мовчання.
Мінімальну довжину інформаційної РНК (мРНК) можна знайти за допомогою множення кількості амінокислот у білку на 3 і додавання 3. Це пояснюється тим, що 3 азотисті основи кодують кожну амінокислоту, а кожна молекула інформаційної РНК має стоп-кодон із 3 азотистих основ, який допомагає припинити трансляцію.
Мала інтерферуюча РНК (siRNA), іноді відома як коротка інтерферуюча РНК або мовчазна РНК, — це клас дволанцюгових РНК, спочатку некодуючих молекул РНК, зазвичай довжиною 20–24 (зазвичай 21) пар основ, подібних до мікроРНК, і працює в межах шляху РНК-інтерференції (RNAi).
Ключові відмінності між siRNA та miRNA
| siRNA | мікроРНК |
|---|---|
| Структура | |
| Це дуплекси РНК довжиною 21-23 нуклеотиду, що мають динуклеотидний виступ 3'. | Це 19-25 нуклеотидні шпильки РНК, які утворюють дуплекс шляхом асоціації один з одним. |
| Створення пари |
Однак ефективність siRNA може бути обмежена деградація, спричинена ендосомальними нуклеазами та секвестрацією в непродуктивних компартментах [39, 40]. Великі молекули siRNA мають більшу ймовірність захоплення, тоді як катіонні матеріали, що використовуються для доставки, можуть зв’язуватися з ендосомальною мембраною, що призводить до захоплення [41].